（一）国际阶段

1．提出申请

申请人可以在中国在先申请的申请日（优先权日）起12个月内以中文向中国国家知识产权局提出PCT国际申请，并要求中国的优先权，无需提交优先权证明文件。

2．受理专利申请和对专利进行专利性审查

PCT专利申请人在申请的同时就要指定该申请将在哪些成员国有效，这些被指定的国家称为"指定国"。

中国专利局作为PCT受理局认为专利申请文件和专利申请手续完备的，即确定国际申请日。国际申请日表示自该申请日起，PCT国际申请在每一个"指定国"具有相当于正规的国内申请的效力，该申请日也成为在该指定国的实际申请日。

PCT受理局将对国际PCT申请的文件进行形式审查，审查合格后则将国际PCT申请文件分别送交世界知识产权组织国际局和国际检索单位。

3．国际检索

PCT专利申请提交后，在规定的时间内，中国专利局作为国际检索单位将对PCT专利申请进行检索，并做出国际检索报告。该检索报告在规定的时间内将尽快送交PCT专利申请人和世界知识产权组织国际局。

自国际申请日（或优先权日）起满18个月后，国际局将公布PCT国际专利申请和国际检索单位做出的检索报告，并将该申请连同检索报告送交该PCT专利申请要求的"指定国"的专利局。

申请人可根据以上的检索报告，对其专利申请文件进行修改。

4．提出国际初步审查请求。

申请人应在申请同时或在自优先权日起19个月内提出国际初审请求，并交纳审查费。

5．国际初步审查

《专利合作条约》规定，国际初步审查程序不是强制性的。参加条约的国家如果是受PCT第二章约束的，其申请人可以请求国际初步审查单位对其申请进行国际初步审查。

国际初步审查的目的是为了就发明是否具有新颖性、创造性和实用性提出初步的意见。该审查意见对各个指定国没有任何约束力。但是，PCT规定的标准是当前国际上通用的标准,而且该审查意见是由为数不多的国际初步审查单位在国际检索的基础上做出的,所以该报告应当是比较可靠和可以依赖的。

在参加《专利合作条约》时，有些国家不受PCT第二章约束。申请人请求国际初步审查时，只能从受PCT第二章约束的指定国中选定一些使用国际初步审查结果的国家，这些国家被称为"选定国"。

中国专利局作为国际初步审查单位对国际申请进行审查后，将提出国际初步审查报告送交世界知识产权组织国际局并由国际局转交申请人，同时国际局还将国际初步审查报告送交该申请的"选定国"。

国际初审单位出据国际初审报告，申请人可根据该报告对其专利申请文件进行修改。

（二）国家阶段

申请人可在自优先权日起30个月届满前选择PCT成员国，并向该国专利局申请其国家专利，即：进入该国的国家阶段。

PCT国际申请进入国家阶段时，须要将申请文件翻译为申请国的官方语言，其主要程序与在国内申请专利相同，即包括：申请进入、公布、实质审查、授权等程序。对于实用新型，大多数国家无须实质审查即可授权；有些国家没有实用新型专利，如：美国、加拿大、英国等，在这些国家只能申请发明专利。

虽然国家阶段的费用与单独在各个国家申请国家专利的费用差不多，但是其优点是可以将优先权期限从12个月延长到30个月向其成员国申请国家专利(有些国家或地区可延至31个月)，使申请人有更多的时间来决定进入哪些国家申请相同主题的专利，并根据检索报告和初审报告修改专利申请文件，以满足发明创造的新颖性、创造性和专利性。

完成进入不同国家的国家阶段的工作后，申请人则拥有不同国家的专利，他们相互独立，每一项都需要缴纳年费。